脫落細(xì)胞里都有啥
接觸痕是法醫(yī)實(shí)踐中最常見的微量樣本種類之一,在此前的文章中,我們介紹了法醫(yī)科學(xué)家們對接觸DNA來源探索的部分努力(脫落細(xì)胞?接觸DNA從哪里來?)。但受限于當(dāng)時的技術(shù)水平,以形態(tài)學(xué)為主的研究限制了結(jié)果的適用范圍和說服力。近年來,成熟的現(xiàn)代生物學(xué)技術(shù)越來越多的在法醫(yī)學(xué)領(lǐng)域得以應(yīng)用,而法醫(yī)科學(xué)家們也始終沒有忽視對于接觸痕、脫落細(xì)胞的進(jìn)一步探索。2020年,倫敦國王學(xué)院的研究團(tuán)隊(duì)發(fā)表題為Illuminating touch deposits throughcellular characterization of hand rinses and body fluids with nucleic acidfluorescence的文章,通過流式細(xì)胞術(shù)和顯微鏡觀察,研究了手部接觸脫落物的組成。
根據(jù)前人的文獻(xiàn),接觸DNA的來源可能十分多樣化:一方面,盡管脫落的角質(zhì)細(xì)胞不含細(xì)胞核,但細(xì)胞外仍可能有游離的DNA的存在;另一方面,碎片化、降解的細(xì)胞也可能釋放游離的細(xì)胞核;最后,接觸脫落物也可能并非源自手上,而是手與其他更豐富的有核細(xì)胞源(如鼻子,眼睛或嘴巴)接觸后積累在手上的。多樣的來源使得實(shí)際樣本過于復(fù)雜、不可控,因而本次研究選取了5種受控的單一來源模擬接觸脫落物:
未洗過的手:志愿者用無菌PBS輕輕擦洗未清洗過的手,每次2ml,共6ml。將擦洗后的液體收集在無菌稱量皿中,并轉(zhuǎn)移至1.5ml離心管中。
洗過的手:志愿者用肥皂洗手,并在自來水中徹底沖洗1-2分鐘,然后避免接觸,風(fēng)干。重復(fù)上一類樣品的收集流程。
唾液:志愿者在收集前至少1小時不吃不喝,用水短暫漱口后讓唾液在嘴中積聚幾分鐘。這樣做是為了最大程度地減少刮擦的頰細(xì)胞,而將收集的重點(diǎn)放在最有可能出現(xiàn)在可轉(zhuǎn)移唾液中的細(xì)胞上。隨后在無菌稱量皿中收集3ml唾液,并用3mlPBS稀釋。
鼻腔灌洗液:志愿者使用無菌一次性移液器,將每次2ml總共6ml的PBS加入自己的鼻腔(兩個鼻孔)中,在研究人員的指導(dǎo)下進(jìn)行鼻灌洗。在液體離開鼻腔、與外部皮膚接觸之前,將其收集在無菌稱量皿中。
洗眼液:志愿者使用無菌洗眼杯,用每次2ml總共6ml的PBS洗睜開的右眼,收集液體轉(zhuǎn)移到1.5ml離心管中
將每種樣品用以下每種條件染色:噻唑橙(TO,84nmol/L),碘化丙啶(PI,2.15μmol/L),DiamondDye(DD,1X),組合的TO/PI(84nmol/LTO,2.15μmol/LPI)。TO是一種可滲透細(xì)胞的花青染料,而PI則不會滲透到活的、完整的細(xì)胞中。兩者都將在核酸結(jié)合后發(fā)出熒光,并廣泛用于顯微鏡和流式細(xì)胞儀中。一起使用時,可以區(qū)分活細(xì)胞和死細(xì)胞,或完整細(xì)胞和受損細(xì)胞。DD是一種DNA結(jié)合染料,用于檢測電泳凝膠中的核酸。
圖1. 在流式細(xì)胞儀上單個樣本的每種樣品類型的FSC v. SSC圖。X軸表示前向散射(大小),Y軸表示側(cè)向散射(粒度)。大小按色彩分類(綠色:6μm以下,粉紅色:6–10μm,藍(lán)色在10-15μm,紅色:在15μm以上)。
所有樣品類型均顯示出高密度的小、低粒度事件,說明有大量碎片;然后是分布更大的大粒度事件,反映完整的細(xì)胞。圖1可見接觸脫落物中,既有完整細(xì)胞大?。?5–50μm),也有更小的(通常低于10μm)細(xì)胞碎片、體液中的游離細(xì)胞核、白細(xì)胞等。
圖1中唾液、洗過的手和未洗過的手都包含相對較大的細(xì)胞群,而洗眼和洗鼻樣本的大型細(xì)胞數(shù)量較低,且總體細(xì)胞密度較低,這可能是由于收集這些樣品時缺乏摩擦所致。而同樣摩擦少的唾液細(xì)胞密度更高,可能表明口腔粘膜比鼻子或眼睛更容易脫落細(xì)胞。
總體而言,單一樣本的細(xì)胞分布差別不夠大,不足以通過細(xì)胞分布來揭示復(fù)雜的脫落沉積物的主要來源。

圖3. 6名志愿者洗過的手樣本的FSC v. SSC圖。
為了評估每日變化對每個被檢查的體液中單個細(xì)胞脫落的影響,在5天中分別采樣,所有樣本沒有顯著差異(p>0.05)。而在不同個體中,大于15μm的大細(xì)胞事件的百分比范圍從7.4%至57.2%,任何兩個捐贈者的大細(xì)胞群體百分比之間的最大差異平均值為30.9%,這比每個個體中最大差異的平均值高18.9%,但仍沒有達(dá)到統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著差異(p=0.12)。
使用熒光核酸染料來定位樣品中的DNA,即確定哪些大小的細(xì)胞或片段包含遺傳物質(zhì)。熒光強(qiáng)度高于未染色對照樣品的測量自身熒光強(qiáng)度的任何顆?;蚣?xì)胞即認(rèn)為是“ DNA(+)”,因?yàn)樗鼈兊臒晒獗砻鞔嬖诤怂帷?

圖5. 左:PI染色的洗過的手樣本的FSC v. SSC圖(左上)顯示角質(zhì)形成細(xì)胞簇(>15μm)和白細(xì)胞/碎片(<10μm)。紅色表示檢測到的核酸熒光高于黑色(左下)所示的自然自發(fā)熒光水平。特寫(右)顯示很少的DNA+事件。
右:未洗過的手樣本的分布和熒光圖相同。特寫(右)顯示出有限的含核酸碎片,比唾液中可觀察到的碎片要少得多,比洗過的手樣本多。
所有樣本都做了核酸染色,其中洗過的手對接觸脫落物的含量信息最多,而唾液有望包含全部潛在的DNA來源(即完整的有核細(xì)胞,無核角質(zhì)細(xì)胞,小白細(xì)胞,游離核和降解的細(xì)胞片段)。
對于唾液樣本,TO不僅染色了角質(zhì)形成細(xì)胞(>15μm),還對大部分小細(xì)胞/碎片(6-15μm)進(jìn)行了染色,這可能是由于存在大量白細(xì)胞。PI染色則表明大多數(shù)細(xì)胞被破壞且含有DNA。
而對于洗過的手樣本,其DNA+幾乎完全位于大細(xì)胞大小區(qū)域中。在PI或TO染色的小細(xì)胞/片段大小范圍內(nèi)幾乎沒有DNA+事件發(fā)生(圖5)。這表明洗手液中游離核或含有DNA的細(xì)胞碎片的發(fā)生率受到限制。
有趣的是,在洗過的手和未洗過的手中都觀察到了相似的結(jié)果,表明手上并沒有積累很多富含DNA的生物材料,接觸DNA實(shí)際上可能是無細(xì)胞的游離DNA或由完整的細(xì)胞(如無核角質(zhì)細(xì)胞)提供。

顯微鏡觀察洗過的和未洗過的手樣本顯示出大量的雙熒光無核角質(zhì)細(xì)胞,它們也存在于唾液中,很少出現(xiàn)在洗眼液和洗鼻液中。有核上皮細(xì)胞僅在唾液中完全可見。鼻腔灌洗顯示偶有角質(zhì)細(xì)胞和一些不規(guī)則的熒光,可能是具有彌散性核酸的粘液;在兩個樣品中,DiamondDye觀察到小的明亮的白細(xì)胞。洗眼液包含的細(xì)胞很少(與流式細(xì)胞術(shù)一致),僅包含稀有的熒光顆粒。當(dāng)在洗眼液和洗鼻液中看到熒光時,它通常是很小的顆粒或廣泛的低強(qiáng)度涂片,而不是可識別的細(xì)胞。
在顯微鏡下觀察到的任何角質(zhì)細(xì)胞中都缺乏核,然而這些無核細(xì)胞確實(shí)對多種核酸染料的DNA呈陽性。脫落的角質(zhì)細(xì)胞的角質(zhì)包膜似乎不能防止PI染色。這可能是因?yàn)榻琴|(zhì)細(xì)胞死亡并脫落,因此它們的膜是可滲透的。另一種可能性是,角質(zhì)細(xì)胞的核酸染色反映了小的、膜結(jié)合的DNA片段的存在,這些片段可能是從汗液中存在的游離DNA中結(jié)合的。
流式細(xì)胞術(shù)的數(shù)據(jù)和顯微鏡觀察到的角質(zhì)細(xì)胞中的DNA+染色結(jié)果,揭示了無核細(xì)胞含有大量DNA。終末分化期,間核和其他細(xì)胞器(尤其是包含DNA的線粒體)的降解可能會在角質(zhì)細(xì)胞內(nèi)留下殘留的核酸。需要注意的是,這些DNA和無細(xì)胞游離DNA一樣,可能存在高度片段化的情況,對于標(biāo)準(zhǔn)法醫(yī)STR完整擴(kuò)增貢獻(xiàn)有限,但其豐富的含量完全值得通過其方法(例如SNP)加以利用,使其成為接觸DNA證據(jù)有價(jià)值的附加來源。
流式細(xì)胞術(shù)在小細(xì)胞/碎片大小的數(shù)據(jù)表面,盡管碎片是接觸脫落物中占據(jù)較大比例,但它并不包含大量的DNA陽性碎片細(xì)胞或游離核。盡管在顯微鏡下檢查的樣本可能沒有捕獲到所有DNA(+)細(xì)胞片段,但這些數(shù)據(jù)表明碎片對接觸沉積物的DNA含量貢獻(xiàn)有限。因此,在DNA提取中過濾、除雜的過程中,即使將分離尺徑縮小至6-15μm也幾乎不會增加DNA損失的風(fēng)險(xiǎn)。
原文鏈接:
https://doi.org/10.1016/j.fsigen.2020.102269